Kemunculan BEM Bersatu menuai kontroversi. Sejumlah universitas membantah keterlibatan dengan organisasi tersebut.

Aliansi mahasiswa BEM bersatu menyatakan penolakan gerakan mahasiswa yang ditunggangi kepentingan politik.

Aliansi mahasiswa bernama BEM Bersatu menyatakan sikap menolak gerakan mahasiswa yang ditunggangi kepentingan politik praktis.