Entre los señalamientos figuran incompatibilidad laboral, intento de agresión, presunto encubrimiento y vínculos con la actual rectora Arcelia Olga Rojas Salazar, investigada por negociación incompatible y aprovechamiento indebido en la fiscalía. Fuentes vinculadas a la Universidad Nacional del Callao cuestionan la trayectoria del candidato al rectorado Augusto Caro Anchay y lo relacionan con la gestión de la Universidad Inca Garcilaso de la Vega cuando perdió su licenciamiento dejando miles de estudiantes afectados.