تغییر ناگهانی مسیر تشییع علی خامنه‌ای، رهبر پیشین جمهوری اسلامی، با وجود هفته‌ها تبلیغات و اطلاع‌رسانی رسمی، با انتقاد شماری از چهره‌های نزدیک به حکومت و حامیان جمهوری اسلامی روبه‌رو شده است؛ انتقادهایی که از «سوءمدیریت»، «اطلاع‌رسانی نادرست» و حتی «دروغ» در برگزاری این مراسم سخن می‌گویند.

بر اساس برنامه‌ای که پیش‌تر از سوی مقام‌های جمهوری اسلامی اعلام شده بود، قرار بود خودروی حامل پیکر علی خامنه‌ای از خیابان دماوند در شرق تهران حرکت کرده و پس از طی مسیری طولانی به میدان آزادی برسد. با این حال، در روز مراسم، تریلی حامل تابوت‌ها تنها از محدوده نزدیک دانشگاه صنعتی شریف تا میدان آزادی حرکت کرد و هزاران نفر که از ساعات اولیه صبح در شرق تهران منتظر بودند، از این تغییر مسیر بی‌اطلاع ماندند.

در پی اعتراض شرکت‌کنندگان، حسن حسن‌زاده، فرمانده سپاه محمد رسول‌الله تهران بزرگ و رییس ستاد برگزاری مراسم، از مردم عذرخواهی کرد. او علت تغییر مسیر را «حضور گسترده و زودهنگام مردم» و بسته شدن معابر عنوان کرد.

با این حال، این توضیح نتوانست انتقادها را متوقف کند.

مهدی فضائلی، عضو دفتر حفظ و نشر آثار خامنه‌ای، نیز در یادداشتی در شبکه‌های اجتماعی، ضمن تمجید از مراسم، از عملکرد رسانه‌ای آن انتقاد کرد. او نوشت که با وجود «نقاط قوت فراوان»، صداوسیما نتوانسته «گوشه‌ای از گلایه‌های مردمی» را که احساس می‌کردند در تشییع «رودست خورده‌اند» منعکس کند.