La Comisión de Control y Transparencia de la Policía vasca, un órgano externo que revisa los dispositivos tanto de la Ertzaintza como de los cuerpos locales, ha iniciado ya su investigación sobre las cargas acontecidas en el aeropuerto de Loiu, el que da servicio a Bilbo, durante la llegada de miembros de la Global Sumud Flotilla. Este organismo, presidido desde este año por Enrique Lucas, exvocal en el Consejo General del Poder Judicial a propuesta del PNV, ha realizado una batería de solicitudes al Gobierno vasco, incluida una copia de los informes emitidos, todas las grabaciones de vídeo, las posibles imágenes tomadas por los agentes actuantes por medio de sus 'bodycam' y las comunicaciones por radio.

El expediente 5/2026 de la comisión arranca con una breve descripción de los hechos realizada por el propio consejero de Seguridad, Bingen Zupiria, en la misma tarde del sábado en que se produjeron las cargas. Zupiria explica que en Loiu se celebró “una concentración no comunicada” para recibir a los activistas y “conformaba por unas 30 personas que ostentaban banderas palestinas”. Añade que “derivada de la misma, se han producido incidentes de orden público que han hecho necesaria la intervención directa de agentes de la Ertzaintza”. Prosigue explicando que, “resultado de los altercados se ha procedido a la detención de cuatro personas por delitos de atentado, resistencia y desobediencia grave”. Igualmente, se incoaron sanciones administrativas en aplicación de la normativa de Seguridad Ciudadana, más conocida como 'ley mordaza'.